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在兰州土壤检测工作中，土壤有机质是土壤固相部分的重要组成成分，尽管土壤有机质的含量只占土壤总量的很小一部分，但它对土壤肥力、土壤耕性影响很大。资料显示，在一定范围内，有机质的含量与土壤肥力水平呈正相关。
土壤有机质的含量在不同土壤中差异较大，含量高的可达20%或30%以上，含量低的不足1%。而适合蔬菜栽培的土壤有机质应保持在20%以上。寿光市土壤肥料测试与研究中心提供的数据显示，有机质含量在20g/kg以上的大棚土壤往往表现出透水透气性好、供肥能力强、不容易出现板结以及盐渍化的情况。而大多数的大棚土壤普遍达不到20g/kg这个标准，在这样的土壤中种植蔬菜如果持续大量施肥就会有发生盐渍化的风险。
提高土壤有机质，通常采取的办法就是加大粪肥的投入，如鲜鸡粪、猪粪、鸭粪以及稻壳粪、秸秆等等。近几年市场上出现了较多的商品有机肥，这些以动物粪便、城市垃圾、枯枝落叶等为原料进行发酵腐熟、加工制作后的有机肥也是提高大棚土壤有机质的来源。
总之，土壤有机质就是润滑剂，有机质含量高的土壤，热量、水分、气体以及各种营养代谢协调快速，对蔬菜生长十分有利。
土壤酸碱度
土壤酸碱度影响着土壤的供肥能力和蔬菜的健康生长。多数的蔬菜喜欢中性土壤，即pH值在6.5-7.5之间。资料显示，土壤中的各种矿质营养在酸碱度为中性时有效性.高，土壤偏酸或偏碱都会影响一部分元素，尤其是微量元素的吸收。
在酸性土壤中，土壤中的磷酸易与铁、铝离子结合成不溶物而被固定，影响蔬菜对磷的吸收；钾、钙等元素易被过多的氢离子取代而淋失掉；另外，酸性土壤中铜、锌、锰、硼等微量元素溶解增大，如果再增施微肥，有可能使蔬菜受害。而在碱性土壤中，水溶性磷酸根又易与钙结合成难溶的磷酸钙，降低肥效；还固定铁锌等微量元素，使蔬菜发生缺铁症。
土壤pH值为6—8时，有效氮含量较高；pH值为6.5左右时，磷的有效性.高；pH值大于6时，土壤钾、钙、镁含量高；pH值为4.7—6.7时；硼的有效性高；pH值大于7时，硼的可溶性明显降低。